Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HRCP23327 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HRCP23327 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HRCP23327 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HRCP23327 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HRCP23327 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms