Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms