Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD53P19397 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms