Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRB1P18505 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms