Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT10P13645 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms