Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2C1P13056 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR2C1P13056 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NR2C1P13056 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NR2C1P13056 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms