Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms