Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHGAP10645 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHGAP10645 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms