Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms