Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms