Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTMAP06454 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTMAP06454 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms