Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYBBP04839 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYBBP04839 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYBBP04839 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYBBP04839 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms