Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms