Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBNO60934 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBNO60934 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NBNO60934 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms