Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPLO60437 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPLO60437 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPLO60437 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms