Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms