Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TO15178 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TO15178 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms