Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLIC1O00299 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIC1O00299 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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