Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1D1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1D1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms