Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM221AA4D161 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM221AA4D161 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms