Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms