Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TARSL2A2RTX5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TARSL2A2RTX5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TARSL2A2RTX5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TARSL2A2RTX5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TARSL2A2RTX5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms