Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms