Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms