Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms