Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALD1Q9ULE6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms