Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms