Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms