Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms