Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPG2Q9UBF2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms