Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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LRFN1Q9P244 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LRFN1Q9P244 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LRFN1Q9P244 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LRFN1Q9P244 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LRFN1Q9P244 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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