Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms