Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RLIMQ9NVW2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms