Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LMBRD1Q9NUN5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMBRD1Q9NUN5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms