Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms