Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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MMP26Q9NRE1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP26Q9NRE1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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