Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRDM9Q9NQV7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PRDM9Q9NQV7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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