Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX5Q9H2C1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX5Q9H2C1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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