Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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