Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPR88Q9GZN0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms