Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms