Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms