Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms