Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2AFJQ9BTM1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms