Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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