Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms