Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms