Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNL2Q96S94 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms