Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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