Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms